تم تأسيس كلٌية ال ٌصيدلة / طبرق عام 2003م كفرع من كلٌية الصيدلة / جامعة عمر المختار وذلك بموجب القرار رقم ( 1218)لسنة1369 و.ر الصادر عن مكتب شؤون الخدمات بتاريخ 1369/11/11 و.ر وذلك تماشياً مع السياسة التعلٌيمية العليا بالجامعة، التي تدعو إلى توسع قاعدة التعلٌيم العالًي وسد احتياجات المجتمع من التخصصات المختلفة.
تعد كلية الصيدلة إحدى أهم الكليات التي كانت حجر الأساس في إنشاء الجامعة والتي بدأت بقبول الطلاب للدراسة في عام 2003م
تلتزم الكلية برفع القطاع الصحي في ليبيا عامةً وفي بلدية طبرق خاصةً بصيادلة ذوي كفاءة عالية، وذلك من خلال تقديمها لبرنامج أكاديمي مناسب لمرحلة البكالوريوس، يستجيب للمعايير العالمية، ويخدم متطلبات سوق العمل المحلية والإقليمية